Protein–RNA interactions for Protein: P21741

MDK, Midkine, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDKP21741 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDKP21741 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDKP21741 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MDKP21741 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDKP21741 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDKP21741 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDKP21741 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms