Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms