Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAA2P0DJI9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA2P0DJI9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms