Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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ZBED1O96006 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZBED1O96006 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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