Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3JO75822 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms