Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SURF6O75683 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SURF6O75683 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SURF6O75683 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SURF6O75683 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms