Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTSVO60911 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTSVO60911 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTSVO60911 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTSVO60911 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTSVO60911 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTSVO60911 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms