Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNQ3O43525 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNQ3O43525 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms