Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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