Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms