Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms