Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms