Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CRACR2AQ9BSW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms