Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX2Q9BQ50 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms