Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ALS2CR12Q96Q35 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms