Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ODF3Q96PU9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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