Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TPD52L3Q96J77 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms