Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NMD3Q96D46 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms