Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms