Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RFKQ969G6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms