Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C11orf40Q8WZ69 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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C11orf40Q8WZ69 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf40Q8WZ69 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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