Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC12Q8WUD4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms