Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHDC4Q8TBB5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHDC4Q8TBB5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms