Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEMA6DQ8NFY4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms