Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf62Q8N4C0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms