Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms