Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
C16orf54Q6UWD8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms