Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DUX4L9Q6RFH8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms