Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
JMJD6Q6NYC1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JMJD6Q6NYC1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms