Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CEP170Q5SW79 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CEP170Q5SW79 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms