Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC38Q502W7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC38Q502W7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms