Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TXNRD1Q16881 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TXNRD1Q16881 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms