Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3GAP1Q15042 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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