Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PMS2P11Q13670 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PMS2P11Q13670 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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