Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PRKAA1Q13131 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRKAA1Q13131 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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