Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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TRAF3Q13114 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAF3Q13114 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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