Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXF2Q12947 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXF2Q12947 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF2Q12947 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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