Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXF1Q12946 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FOXF1Q12946 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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