Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TROQ12816 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TROQ12816 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TROQ12816 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TROQ12816 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TROQ12816 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TROQ12816 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TROQ12816 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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