Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD300CQ08708 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms