Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACTA2P62736 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms