Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GSCP56915 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GSCP56915 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GSCP56915 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GSCP56915 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSCP56915 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSCP56915 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSCP56915 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSCP56915 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSCP56915 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSCP56915 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms