Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAG2P55895 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAG2P55895 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAG2P55895 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAG2P55895 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAG2P55895 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms