Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CRIP1P50238 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms