Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA4P43694 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA4P43694 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms