Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXD12P35452 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXD12P35452 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms