Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTGS2P35354 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms