Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DUSP1P28562 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms