Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LIG1P18858 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LIG1P18858 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LIG1P18858 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIG1P18858 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIG1P18858 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIG1P18858 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIG1P18858 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms