Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYBBP04839 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CYBBP04839 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CYBBP04839 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms